جلد دوم از موسوعه رد شبهات است که به موضوع «قرآن» اختصاص یافته است و شامل مقالاتی با این عناوین است: مصحف آسمانی غیر قرآن؛ اعتقاد به تحریف قرآن برای اثبات امامت؛ شیعه و قرآن خاص.